MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p4

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021989	ATA	2	6	23	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230078
2	NC_021989	ATTT	2	8	77	84	25 %	75 %	0 %	0 %	529230078
3	NC_021989	GAAAA	2	10	105	114	80 %	0 %	20 %	0 %	529230078
4	NC_021989	AGA	2	6	123	128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
5	NC_021989	AATT	2	8	155	162	50 %	50 %	0 %	0 %	529230078
6	NC_021989	TAA	2	6	206	211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230078
7	NC_021989	A	8	8	219	226	100 %	0 %	0 %	0 %	529230078
8	NC_021989	TTTA	2	8	241	248	25 %	75 %	0 %	0 %	529230078
9	NC_021989	A	6	6	257	262	100 %	0 %	0 %	0 %	529230078
10	NC_021989	TGAA	2	8	308	315	50 %	25 %	25 %	0 %	529230078
11	NC_021989	ATT	2	6	318	323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230078
12	NC_021989	GAA	2	6	337	342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
13	NC_021989	AT	3	6	348	353	50 %	50 %	0 %	0 %	529230078
14	NC_021989	AGA	2	6	463	468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
15	NC_021989	A	6	6	472	477	100 %	0 %	0 %	0 %	529230078
16	NC_021989	AGA	2	6	498	503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
17	NC_021989	GA	3	6	543	548	50 %	0 %	50 %	0 %	529230078
18	NC_021989	A	6	6	577	582	100 %	0 %	0 %	0 %	529230078
19	NC_021989	A	7	7	637	643	100 %	0 %	0 %	0 %	529230078
20	NC_021989	ATTT	2	8	682	689	25 %	75 %	0 %	0 %	529230078
21	NC_021989	GAA	2	6	691	696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230078
22	NC_021989	ATA	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230078
23	NC_021989	ATT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230079
24	NC_021989	GCAA	2	8	825	832	50 %	0 %	25 %	25 %	529230079
25	NC_021989	TTA	2	6	865	870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230079
26	NC_021989	TA	3	6	953	958	50 %	50 %	0 %	0 %	529230079
27	NC_021989	TA	3	6	997	1002	50 %	50 %	0 %	0 %	529230079
28	NC_021989	GAA	2	6	1048	1053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
29	NC_021989	AAC	2	6	1070	1075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230079
30	NC_021989	AAT	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230079
31	NC_021989	CAA	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230079
32	NC_021989	GAA	2	6	1198	1203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
33	NC_021989	AGA	2	6	1209	1214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
34	NC_021989	ACT	2	6	1222	1227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230079
35	NC_021989	TTCT	2	8	1229	1236	0 %	75 %	0 %	25 %	529230079
36	NC_021989	GAA	2	6	1237	1242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
37	NC_021989	AC	3	6	1260	1265	50 %	0 %	0 %	50 %	529230079
38	NC_021989	A	6	6	1266	1271	100 %	0 %	0 %	0 %	529230079
39	NC_021989	GAA	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230079
40	NC_021989	TGG	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529230079
41	NC_021989	A	6	6	1329	1334	100 %	0 %	0 %	0 %	529230080
42	NC_021989	TCT	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230080
43	NC_021989	AATTGA	2	12	1421	1432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	529230080
44	NC_021989	ATT	2	6	1439	1444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230080
45	NC_021989	ACA	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230080
46	NC_021989	GAA	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230080
47	NC_021989	TTGT	2	8	1465	1472	0 %	75 %	25 %	0 %	529230080
48	NC_021989	ATAA	2	8	1484	1491	75 %	25 %	0 %	0 %	529230080
49	NC_021989	TAA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230081
50	NC_021989	AAT	2	6	1816	1821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230081
51	NC_021989	A	7	7	1851	1857	100 %	0 %	0 %	0 %	529230081
52	NC_021989	T	6	6	1865	1870	0 %	100 %	0 %	0 %	529230081
53	NC_021989	AAT	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230081
54	NC_021989	CTATTA	2	12	1908	1919	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	529230081
55	NC_021989	A	7	7	1963	1969	100 %	0 %	0 %	0 %	529230081
56	NC_021989	AT	3	6	2010	2015	50 %	50 %	0 %	0 %	529230081
57	NC_021989	ATA	2	6	2021	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230081
58	NC_021989	ATT	2	6	2044	2049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230081
59	NC_021989	T	8	8	2048	2055	0 %	100 %	0 %	0 %	529230081
60	NC_021989	T	6	6	2057	2062	0 %	100 %	0 %	0 %	529230081
61	NC_021989	T	8	8	2115	2122	0 %	100 %	0 %	0 %	529230081
62	NC_021989	GTT	2	6	2141	2146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529230081
63	NC_021989	T	6	6	2221	2226	0 %	100 %	0 %	0 %	529230081
64	NC_021989	CTTAG	2	10	2240	2249	20 %	40 %	20 %	20 %	529230081
65	NC_021989	TCC	2	6	2258	2263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529230081
66	NC_021989	T	6	6	2265	2270	0 %	100 %	0 %	0 %	529230081
67	NC_021989	A	6	6	2401	2406	100 %	0 %	0 %	0 %	529230082
68	NC_021989	TTA	2	6	2437	2442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230082
69	NC_021989	GGA	2	6	2449	2454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529230082
70	NC_021989	GGA	3	9	2515	2523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529230082
71	NC_021989	AGA	2	6	2535	2540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230082
72	NC_021989	TCT	2	6	2548	2553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230082
73	NC_021989	TGC	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529230082
74	NC_021989	GGC	2	6	2575	2580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529230082
75	NC_021989	TAC	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230082
76	NC_021989	TGGT	2	8	2751	2758	0 %	50 %	50 %	0 %	529230082
77	NC_021989	A	6	6	2771	2776	100 %	0 %	0 %	0 %	529230082
78	NC_021989	A	8	8	2831	2838	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
79	NC_021989	T	7	7	2880	2886	0 %	100 %	0 %	0 %	529230083
80	NC_021989	CTA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
81	NC_021989	TA	3	6	2926	2931	50 %	50 %	0 %	0 %	529230083
82	NC_021989	GAT	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230083
83	NC_021989	TA	3	6	2985	2990	50 %	50 %	0 %	0 %	529230083
84	NC_021989	AATATT	2	12	3021	3032	50 %	50 %	0 %	0 %	529230083
85	NC_021989	CTG	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529230083
86	NC_021989	AACT	2	8	3061	3068	50 %	25 %	0 %	25 %	529230083
87	NC_021989	AACA	2	8	3093	3100	75 %	0 %	0 %	25 %	529230083
88	NC_021989	A	8	8	3114	3121	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
89	NC_021989	TAA	2	6	3158	3163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
90	NC_021989	T	6	6	3200	3205	0 %	100 %	0 %	0 %	529230083
91	NC_021989	AAATAT	2	12	3206	3217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
92	NC_021989	CAAA	2	8	3280	3287	75 %	0 %	0 %	25 %	529230083
93	NC_021989	A	6	6	3303	3308	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
94	NC_021989	CTA	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
95	NC_021989	ATCA	3	12	3333	3344	50 %	25 %	0 %	25 %	529230083
96	NC_021989	TATT	2	8	3397	3404	25 %	75 %	0 %	0 %	529230083
97	NC_021989	TAC	2	6	3410	3415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
98	NC_021989	GAAA	2	8	3440	3447	75 %	0 %	25 %	0 %	529230083
99	NC_021989	A	8	8	3455	3462	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
100	NC_021989	T	7	7	3556	3562	0 %	100 %	0 %	0 %	529230083
101	NC_021989	AT	3	6	3567	3572	50 %	50 %	0 %	0 %	529230083
102	NC_021989	T	6	6	3587	3592	0 %	100 %	0 %	0 %	529230083
103	NC_021989	TCT	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529230083
104	NC_021989	GTA	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529230083
105	NC_021989	T	6	6	3635	3640	0 %	100 %	0 %	0 %	529230083
106	NC_021989	TATC	2	8	3662	3669	25 %	50 %	0 %	25 %	529230083
107	NC_021989	A	6	6	3683	3688	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
108	NC_021989	A	6	6	3695	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
109	NC_021989	TAA	2	6	3787	3792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
110	NC_021989	AAT	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
111	NC_021989	ACT	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
112	NC_021989	ACAAA	2	10	3853	3862	80 %	0 %	0 %	20 %	529230083
113	NC_021989	ACA	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529230083
114	NC_021989	AGA	2	6	3896	3901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230083
115	NC_021989	ACT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529230083
116	NC_021989	A	6	6	3915	3920	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
117	NC_021989	AGA	2	6	3946	3951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230083
118	NC_021989	TAT	2	6	3965	3970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
119	NC_021989	AAT	2	6	4002	4007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
120	NC_021989	T	6	6	4014	4019	0 %	100 %	0 %	0 %	529230083
121	NC_021989	CTG	2	6	4066	4071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529230083
122	NC_021989	GAA	2	6	4128	4133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230083
123	NC_021989	TAA	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
124	NC_021989	ACTA	2	8	4166	4173	50 %	25 %	0 %	25 %	529230083
125	NC_021989	A	6	6	4191	4196	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
126	NC_021989	A	7	7	4222	4228	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
127	NC_021989	AGA	2	6	4235	4240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529230083
128	NC_021989	CTC	3	9	4264	4272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529230083
129	NC_021989	TAA	3	9	4328	4336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529230083
130	NC_021989	TTA	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
131	NC_021989	ATT	2	6	4439	4444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
132	NC_021989	AT	3	6	4453	4458	50 %	50 %	0 %	0 %	529230083
133	NC_021989	TGG	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529230083
134	NC_021989	ATT	2	6	4475	4480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
135	NC_021989	T	6	6	4479	4484	0 %	100 %	0 %	0 %	529230083
136	NC_021989	T	6	6	4512	4517	0 %	100 %	0 %	0 %	529230083
137	NC_021989	TA	3	6	4533	4538	50 %	50 %	0 %	0 %	529230083
138	NC_021989	ATT	2	6	4601	4606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529230083
139	NC_021989	A	8	8	4612	4619	100 %	0 %	0 %	0 %	529230083
140	NC_021989	TAAA	2	8	4621	4628	75 %	25 %	0 %	0 %	529230083
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.